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所级科学数据中心 生物信息技术培训 培训主题:基因组组装 时间:9月29日主讲人:高胜寒(中科院微生物所) 上机答疑:朱倩慧、余涛、赵宇慧、葛胤辰 培训安排: 时间 课程安排 上午9:第一讲00-12:00 第二讲 组装基本概念测序技术介绍 第三讲 数据获取及原始数据处理 第四讲 矫正和组装 下午13:第五讲00-17:00 修正与组装质量评估 内容
1.基因组测序、组装定义
2.基因组组装的意义
3.基因组组装如何实现
4.基因组组装的应用
1.一、
二、三代主流测序技术基本 原理
2.三代测序类型及优势
3.其它辅助组装技术
1.样本制备
2.测序
3.数据预处理
1.测序数据矫正
2.组装方案介绍
3.组装算法介绍
1.评估组装结果
2.修正组装错误
3.基本参数评估
4.组装完整度评估
5.基因完整度评估 第六讲 组装实例 第七讲 上机实践
1.组装流程
2.结果解读熟悉组装流程,上机操作 主讲人简介:高胜寒,博士,参与组装了HuangZaoSiMaize,mango,rubbertree,PrunusarmeniacaL.,GiantPandaRoundworm,Agrocybecylindracea等多个物种的基因组,在GenomeBiology,NaturePlants等杂志发表论文多篇。
培训报名:
1.报名注册:/vj/wjYAzUK.aspx
2.注册截止日期:9月22日
3.培训费(住宿自理):所内800元/人,所外1200元/人
4.缴费方式:所内课题组ARP收费,所外银行转账账户名:中国科学院遗传与发育生物学研究所账号:4180开户行:工行东升路支行 备注:
1.本次培训采用小班教学,限20人,按报名先后顺序确定参与培训人员。
填写注册表后,收 到报名确认邮件方为报名成功。

2.请在收到报名确认邮件后于9月26日前缴纳培训费,逾期未缴费者视为放弃。

3.所外银行汇款时请在附言栏注明“基因组组装培训费、注册人姓名(若为多人注册,请注 明所有姓名)及单位名称,并请将汇款凭证扫描件发到zhaoyh@,以便核查。
联系方式:010-64801962,zhaoyh@温馨提示:培训期间请佩戴口罩,做好个人防护。
中国科学院遗传与发育生物学研究所2021年9月15日

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