数据处理方法
一、软件介绍...........................................................................................................
.......................................................................................................
21.2软件的使用...................................................................................................
2 二、ZENblack
操作说明.........................................................................................
22.1打开软件.......................................................................................................
22.2软件界面介绍...............................................................................................
32.3导入数据.......................................................................................................
3 CIBR2.4查看原始信息
...............................................................................................
4 2.5添加标注.......................................................................................................
42.6保存图片，并输出TIFF格式.....................................................................52.7常见图片格式说明.......................................................................................5三、ZENBlue操作说明.........................................................................................63.1打开软件.......................................................................................................
63.2软件界面介绍...............................................................................................
63.3导入数据.......................................................................................................
63.4查看原始信息...............................................................................................
73.5选取图片中感兴趣的区域...........................................................................73.6添加标注.......................................................................................................
83.7手动测量.......................................................................................................
83.8stitching图像拼接......................................................................................103.9OrthogonalProjection正交投影................................................................103.10格式输出为TIFF的方式..........................................................................121 ZENblack&ZENblue数据处理方法 注：Airyscanprocessing不可用离线版
一、软件介绍1.1功能介绍 ZEN是一个集图像采集、基本图像处理和注释以及图像分析的数字显微镜软件。
使用Zeiss880拍摄的图片可用ZENblack离线版或ZENblue离线版处理。
总的来说，ZENBlue的图像处理功能相较ZENBlack更强大。
CIBR1.2软件的使用使用ZENblack&ZENblue软件，可选择：1）使用图形工作站左侧的电脑。
2）拷贝安装包到个人电脑进行安装后使用，安装包在图形工作站左侧 的电脑中。
二、ZENblack操作说明2.1打开软件 1）双击桌面图标打开软件，未与硬件连接的软件打开时会有一些报错提示，点击ok即可。
2 2）选择ImageProcessing进入图像处理界面。
CIBR2.2软件界面介绍 2.3导入数据 在软件上方的工具栏中，选择，导入数据。
3 2.4查看原始信息 选择，可查看图片名称，拍摄日期、时间，拍摄模式，图像大小，扫描模式，zoom值，物镜倍数、Average，使用激光的参数，使用探测器类型，Pinhole大小，滤光片种类，收光波段等原始信息。
CIBR 2.5添加标注 在软件下方的Graphics工具栏中，选择添加文字说明，比例尺，箭头等注释。
在图像上选中添加好的标注点击鼠标右键，选择FormatGraphicalElements，可更改线条颜色，字体大小等格式。
4 2.6保存图片，并输出TIFF格式 1）在工具栏File中选择Export。
2）选择TIFF格式.3）保存路径。
CIBR2.7常见图片格式说明 名称 特点 JPEG格式有损压缩格式，压缩后的体积比较小，有损图像压缩可能 导致较差的文本可读性。
PNG格式无损压缩格式，比较适合矢量图,几何图。
GIF格式 无损压缩格式，可以保存多帧图像，将图像“约束”为8bits/每个像素。
TIFF格式不压缩，最常用于存储和编辑图像。
5 三、ZENBlue操作说明3.1打开软件 双击桌面图标打开软件，未与硬件连接的软件打开时会有一些报错提示，点击ok进入即可。
3.2CIBR软件界面介绍 3.3导入数据 在软件上方的工具栏中，选择，导入数据。
6 3.4查看原始信息 选择，可查看图片名称，拍摄日期、时间，拍摄模式，图像大小，扫描模式，zoom值，物镜倍数、Average，使用激光的参数，使用探测器类型，Pinhole大小，滤光片种类，收光波段等原始信息。
CIBR 3.5选取图片中感兴趣的区域 在下方的Graphics工具栏中，选择。
在图像中用红色虚线方框框选感兴趣区域，在键盘上使用Ctrl+Shift+
C，可将方框中的图像剪贴成一张新的图片。
7 3.6添加标注 在软件界面下方的Graphics工具栏中，可选择添加文字说明，比例尺，箭头等常用注释。
CIBRa.选择 b.选择c.选择 ，添加文字。
，添加比例尺。
，添加箭头。
在图像上选中添加好的标注点击右键，选择FormatGraphicalElements，可以更改线条颜色，字体大小等注释格式。
3.7手动测量 在软件界面下方的Graphics工具栏中， 1）选择 中方框、圆形、不规则形状等常用测量工具。
2）在Measure中，使用选择的测量工具在图像上框选感兴趣的区域。
使用不规则形状，左键：点击定义各个拐点，右键：点击闭合曲线。
8 3）在Graphics工具栏的工具列表中现测量结果的列表。
勾选框，在图像的右侧将出 CIBR4）点击Measure图像显示界面下方工具栏中的CreateDocument。
软 件将测量结果生成一个新的图表文件。
5）在菜单栏File菜单中选择Save，在Save对话框中选择保存文件.xml，可将此图表文件保存为Excel文件。
6）在新生成的图表文件下方的General工具栏中，可选择显示方式。
ChartType图表的显示方式可选择散点图、折线图、柱形图、饼图、环形饼图，根据自己的需求选择。
9 3.8stitching图像拼接 1）在Processing下的Method中选择Stitching选项。
2）在input中选择要拼接的图像。
CIBR3）然后点击 进行拼接，即可完成图像拼接。
3.9OrthogonalProjection正交投影 1）在Processing下的Method中选择OrthogonalProjection选项。
10 2）在input中选择要正交投影的图像。
CIBR3）在Parameters中的Method，选择投影的方式。
4）在startposition选择开始的位置，在Thickness选择投影的层数，可以全部Z轴投影，也可以选择一部分进行投影。
5）然后点击 进行拼接，即可完成图像的正交投影。
11 3.10格式输出为TIFF的方式 1）在Processing界面下的Method工具栏中选择ImageExport。
2）在下方的Parameters栏中选择保存文件的格式为TIFF。
3）保存参数的设置，如：选择保存路径，勾选是否新建folder、xmlfile、zipfile等。
xmlfile文件中包含时间序列、z轴信息等。
CIBR 12